中科院高性能科學計算在生命科學領域應用研討會在上海召開
2007-05-31 來源：中國聚合物網(wǎng)
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由中科院生物局聯(lián)合計算機網(wǎng)絡信息中心主辦，上海生命科學研究院承辦的 “中科院高性能科學計算在生命科學研究領域應用研討會”于 5月29日在上海舉行。來自北京基因組所、上海藥物所、計算生物所、系統(tǒng)生物學中心等上海生科院所屬研究所的專家，生物局和院信息辦的代表，以及計算機網(wǎng)絡信息中心的相關人員等20余人出席了會議，共同探討高性能科學計算在生命科學研究領域的應用與需求。
會上，計算機網(wǎng)絡信息中心超級計算中心主任遲學斌研究員介紹了中科院超級計算環(huán)境與支撐服務情況，超級計算中心牛北方介紹了并行計算及其在生物科學研究中的應用。北京基因組所王晶、上海藥物所熊兵、上海藥物所于坤千、計算生物所徐書華、系統(tǒng)生物學中心王川等分別介紹了高性能計算在基因組學研究、組合數(shù)學與幾何學研究、比較生物學研究、生物數(shù)據(jù)挖掘研究，生物大分子構象變化研究，以及復雜生物分子模擬和藥物虛擬篩選等方面的研究和應用需求。
與會代表就高性能計算的并行計算能力、軟件開發(fā)和移植、存儲需求、數(shù)據(jù)遠程傳輸?shù)确矫孢M行了熱烈的討論，并提出了很多寶貴的建議。專家們認為，生命科學研究對高性能計算機的需求日益增加，F(xiàn)有研究所的計算機資源已經(jīng)不能滿足日益增長的大規(guī)模數(shù)據(jù)和大計算量的需求、迫切需要引進更大處理能力的高性能計算機。生命科學領域一直是高性能計算的重要應用領域，其中很多科學研究工作依賴于高性能計算機。由于現(xiàn)在國內的計算資源與國際同行的差距日益加大，導致國內的科學家的計算規(guī)模無法加大、應用水平難以提高，在應用科學研究中越來越被動，研究及成果與國際先進行列的差距不斷加大。如果不能及時引進新的高性能計算機系統(tǒng)，我國在基因組、生物制藥等生命科學領域的研究與應用將在國際上失去目前的先進地位，無法實現(xiàn)自主創(chuàng)新的科研目標。
專家們認為，作為科學院信息化服務和支撐機構的網(wǎng)絡中心應該配備百萬億次的高性能計算機，支撐研究所科學研究對高性能計算機的需求。網(wǎng)絡中心應進一步加強與各研究所溝通，深入到學科領域，針對生命科學領域的高性能計算應用特點，改善高性能計算環(huán)境，推動生命科學在網(wǎng)絡中心超級計算中心應用的逐步深入。會議最后達成一致意見，研究所將各自計算量的需求統(tǒng)計整理，為院有關領導和相關部門科學決策提供依據(jù)，以保證高性能計算資源更加科學合理地用，進而推動我院科研信息化的發(fā)展。
會上，計算機網(wǎng)絡信息中心超級計算中心主任遲學斌研究員介紹了中科院超級計算環(huán)境與支撐服務情況，超級計算中心牛北方介紹了并行計算及其在生物科學研究中的應用。北京基因組所王晶、上海藥物所熊兵、上海藥物所于坤千、計算生物所徐書華、系統(tǒng)生物學中心王川等分別介紹了高性能計算在基因組學研究、組合數(shù)學與幾何學研究、比較生物學研究、生物數(shù)據(jù)挖掘研究，生物大分子構象變化研究，以及復雜生物分子模擬和藥物虛擬篩選等方面的研究和應用需求。
與會代表就高性能計算的并行計算能力、軟件開發(fā)和移植、存儲需求、數(shù)據(jù)遠程傳輸?shù)确矫孢M行了熱烈的討論，并提出了很多寶貴的建議。專家們認為，生命科學研究對高性能計算機的需求日益增加，F(xiàn)有研究所的計算機資源已經(jīng)不能滿足日益增長的大規(guī)模數(shù)據(jù)和大計算量的需求、迫切需要引進更大處理能力的高性能計算機。生命科學領域一直是高性能計算的重要應用領域，其中很多科學研究工作依賴于高性能計算機。由于現(xiàn)在國內的計算資源與國際同行的差距日益加大，導致國內的科學家的計算規(guī)模無法加大、應用水平難以提高，在應用科學研究中越來越被動，研究及成果與國際先進行列的差距不斷加大。如果不能及時引進新的高性能計算機系統(tǒng)，我國在基因組、生物制藥等生命科學領域的研究與應用將在國際上失去目前的先進地位，無法實現(xiàn)自主創(chuàng)新的科研目標。
專家們認為，作為科學院信息化服務和支撐機構的網(wǎng)絡中心應該配備百萬億次的高性能計算機，支撐研究所科學研究對高性能計算機的需求。網(wǎng)絡中心應進一步加強與各研究所溝通，深入到學科領域，針對生命科學領域的高性能計算應用特點，改善高性能計算環(huán)境，推動生命科學在網(wǎng)絡中心超級計算中心應用的逐步深入。會議最后達成一致意見，研究所將各自計算量的需求統(tǒng)計整理，為院有關領導和相關部門科學決策提供依據(jù)，以保證高性能計算資源更加科學合理地用，進而推動我院科研信息化的發(fā)展。
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（責任編輯：曉靖）
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